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Varsomics

Análisis e identificación de microorganismos por NGS

Plataforma bioinformática rápida y eficiente para la identificación precisa de patógenos asociados con enfermedades infecciosas y para el análisis de microbiomas

Somos parte del mejor Hospital de Latinoamérica:

Conservamos la cultura organizacional de diversidad y calidad del Hospital Israelita Albert Einstein, considerado por el ranking de la revista América Economía Intelligence como el mejor hospital de América Latina.

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Cómo Varsmetagen® puede te ayudar

Tenga el aliado ideal en la práctica de la medicina diagnóstica y el más precisa para enfermedades infecciosas. Entiende con el ejemplo:

Método Tradicional

Diagnóstico genérico de virus
PCR específica para cada patógeno

Viroma + Varsmetagen®

1 solo examen de laboratorio húmedo

Paso a paso

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1. Configuración de rutina

Registre una rutina de análisis especificando los datos básicos, como la tubería de bioinformática deseada, la plataforma de secuenciación y el kit utilizado en el proceso.

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1.Configuración de rutina

Registre una rutina de análisis especificando los datos básicos, como la tubería de bioinformática deseada, la plataforma de secuenciación y el kit utilizado en el proceso.

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2.Sube los archivos

Envíe los archivos sin procesar de secuenciación NGS de muestras clínicas. Varsmetagen es compatible con los principales formatos (FASTQ y FASTQ.GZ) y las principales plataformas de secuenciación (Illumina e Ion Torrent).

Group 15892

3.Tratamiento de datos

Es posible relacionar cada muestra (archivos de entrada) con información como fecha de recolección, tipo de muestra, identificación única, paciente previamente registrado. Luego simplemente comience a procesar y siga el progreso.

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3.Tratamiento de datos

Es posible relacionar cada muestra (archivos de entrada) con información como fecha de recolección, tipo de muestra, identificación única, paciente previamente registrado. Luego simplemente comience a procesar y siga el progreso.

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4.4.Análisis y apoyo a la interpretación de resultados

Una vez que se completa el procesamiento, es posible evaluar las métricas de calidad y la diversidad de microorganismos presentes en cada muestra individualmente. Así, garantizando más seguridad y practicidad en el análisis (interpretación de resultados para la generación de informes e informes).

¡Implemente Medicina de Precisión para el Diagnóstico de Enfermedades Infecciosas!

Confían en nuestro trabajo


Interfaz sencilla y práctica
Simplifique y concentre todas las etapas de análisis e interpretación de resultados en un solo lugar

Análisis más eficiente
Obtenga escalabilidad con múltiples muestras que se procesan simultáneamente

Resultados más claros e intuitivos
Tenga un diagnóstico y caracterización de enfermedades infecciosas con major calidad

Interfaz sencilla y práctica
Simplifique y concentre todas las etapas de análisis e interpretación de resultados en un solo lugar varsacmg

Análisis más eficiente
Obtenga escalabilidad con múltiples muestras que se procesan simultáneamente varsacmg

Resultados más claros e intuitivos
Tenga un diagnóstico y caracterización de enfermedades infecciosas con major calidad varsacmg

Anomalymeter

Puntuación de anomalías que tiene como objetivo resaltar las especies más relevantes en una muestra a través de algoritmos de inteligencia artificial. La herramienta Anomalymeter de Varsmetagen es capaz de identificar organismos más comunes, como las bacterias que forman parte de la microbiota humana, y asignarles una puntuación baja. Por otro lado, los microorganismos atípicos como los patógenos o en abundancia anormal reciben una puntuación alta. De esta forma, el algoritmo ayuda al investigador o analista a priorizar los organismos más relevantes para el análisis.

Caso de Exito

El Proyecto SarsOmics, financiado por el CNPq, surgió al inicio de la pandemia y realiza la secuenciación del virus de la COVID-19, SARS-CoV-2, además de estudiar coinfecciones con otros virus, bacterias y hongos en las vías respiratorias de pacientes con COVID-19. El proyecto ha generado una gran cantidad de datos NGS, y la practicidad y la escalabilidad de Varsmetagen han ayudado en el proceso de análisis e interpretación de estos resultados.

Caso de Exito

El Proyecto SarsOmics, financiado por el CNPq, surgió al inicio de la pandemia y realiza la secuenciación del virus de la COVID-19, SARS-CoV-2, además de estudiar coinfecciones con otros virus, bacterias y hongos en las vías respiratorias de pacientes con COVID-19. El proyecto ha generado una gran cantidad de datos NGS, y la practicidad y la escalabilidad de Varsmetagen han ayudado en el proceso de análisis e interpretación de estos resultados.

Realice el análisis siguiendo las pautas del Colegio de Patólogos Estadounidenses.

Varsmetagen le permite implementar las pautas clave de CAP en su análisis.

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FAQ

Incluso hoy en día, a menudo vemos pacientes con síndrome febril que buscan atención sin que se haya identificado con precisión el agente etiológico, ya que las pruebas de PCR suelen ser específicas para identificar un solo patógeno, lo que hace que el médico ordene varias pruebas. Esto puede consumir un tiempo valioso que podría utilizarse para tratar al paciente. En este sentido, el test virome, combinado con una solución bioinformática única e intuitiva como es varsmetagen, ayudará a llevar el paradigma de la medicina de precisión al diagnóstico de enfermedades infecciosas. Cualquiera que sea el virus, un solo análisis de laboratorio húmedo puede proporcionar los datos para el diagnóstico.

– Analistas de laboratorio que realicen pruebas en el área de metagenómica y genómica de microorganismos y que no tengan conocimientos profundos de bioinformática;

– Bioinformáticos o analistas que enfrentan problemas con las definiciones de conductos para analizar datos de microorganismos;

– Investigadores de microbiología y metagenómica que quieran obtener resultados de análisis

para proyectos y publicaciones;

– Patólogos o infectólogos que deseen inspeccionar o validar resultados para la generación de informes;

Además de proporcionar toda la infraestructura computacional, simplificamos la configuración de pipeline (fijo de trabajo) para analizar datos de microorganismos. De esta manera, no tendrá que preocuparse por las definiciones de parámetros y la configuración de herramientas durante los pasos de procesamiento.

Solicita más información