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Análisis e identificación de microorganismos por NGS

Plataforma bioinformática rápida y eficiente para la identificación precisa de patógenos asociados con enfermedades infecciosas y para el análisis de microbiomas 

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Plataforma para la identificación de microbiomas

Descubre nuestra cartera

Viroma

Diagnóstico del ARN
del virus con alta sensibilidad

Microbioma

detección dirigida de
bacterias y hongos

Metagenómica

Detección de patógenos con alta especificidad y más

Haz una demostración de Varsmetagen

Paso a paso

1.Configuración de rutina

Registre una rutina de análisis especificando los datos básicos, como la tubería de bioinformática deseada, la plataforma de secuenciación y el kit utilizado en el proceso.

2.Sube los archivos

Envíe los archivos sin procesar de secuenciación NGS de muestras clínicas. Varsmetagen es compatible con los principales formatos (FASTQ y FASTQ.GZ) y las principales plataformas de secuenciación (Illumina e Ion Torrent).

3.Tratamiento de datos

Es posible relacionar cada muestra (archivos de entrada) con información como fecha de recolección, tipo de muestra, identificación única, paciente previamente registrado. Luego simplemente comience a procesar y siga el progreso.

4. Análisis y apoyo a la interpretación de resultados

Una vez que se completa el procesamiento, es posible evaluar las métricas de calidad y la diversidad de microorganismos presentes en cada muestra individualmente. Así, garantizando más seguridad y practicidad en el análisis (interpretación de resultados para la generación de informes e informes).

Ventajas de usar Varsmetagen®

Optimización del tiempo de análisis

Reduzca y optimice significativamente el tiempo de procesamiento, clasificación de variantes y generación de informes a partir de muestras genéticas humanas NGS (Next Generation Sequencing).

Apoyo a la interpretación clínica

Se incorporan más de 200 bases de datos de variantes genéticas, incluyendo datos para análisis germinales y somáticos.

Procesamiento automatizado de extremo a extremo

Evaluación de parámetros de calidad, mapeo, llamadores de múltiples variantes, anotación en la base de datos y clasificación previa automática que siguen las pautas de ACMG, AMP, PALC y CAP.

Filtros robustos

El motor de filtrado incorpora todos los datos de mutación anotados, incluidos los fenotipos humanos, el historial clínico del paciente y la enfermedad (OMIM/UniProt).

Somos parte del mejor Hospital de Latinoamérica:

Conservamos la cultura organizacional de diversidad y calidad del Hospital Israelita Albert Einstein, considerado por el ranking de la revista América Economía Intelligence como el mejor hospital de América Latina.

¡Implemente Medicina de Precisión para
el Diagnóstico de Enfermedades Infecciosas!

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Caso de Exito

El Proyecto SarsOmics, financiado por el CNPq, surgió al inicio de la pandemia y realiza la secuenciación del virus de la COVID-19, SARS-CoV-2, además de estudiar coinfecciones con otros virus, bacterias y hongos en las vías respiratorias de pacientes con COVID-19. El proyecto ha generado una gran cantidad de datos NGS, y la practicidad y la escalabilidad de Varsmetagen han ayudado en el proceso de análisis e interpretación de estos resultados.

Caso de Exito

El Proyecto SarsOmics, financiado por el CNPq, surgió al inicio de la pandemia y realiza la secuenciación del virus de la COVID-19, SARS-CoV-2, además de estudiar coinfecciones con otros virus, bacterias y hongos en las vías respiratorias de pacientes con COVID-19. El proyecto ha generado una gran cantidad de datos NGS, y la practicidad y la escalabilidad de Varsmetagen han ayudado en el proceso de análisis e interpretación de estos resultados.